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老鼠的20對染色體上共有約25億個堿基對，與人類23對染色體上的29億個堿基對相稱接近。兩個物種的基因數量大約都是3萬個，相同基因達到99%。通過對比老鼠與人類的基因圖譜，研究職員已經確認了1200個新的人類基因和9000個新的老鼠基因。

目前，這份研究成果中的小家鼠基因組約95%的內容，將向全世界科研職員免費公然，讓大家共享。完整的老鼠基因組圖譜于2005年完成。

因為繁殖速度快、輕易飼養，所以老鼠是生物和醫學實驗中的重要模式實驗動物。人類遺傳疾病基因研究專家、中國協和醫科大學沈巖教授以為，老鼠基因圖譜破解后揭示出的老鼠與人類基因的高度相似性，使得科學家可以將老鼠與人類基因進行對比研究，盡快找出那些引發人類癌癥、心臟病、艾滋病等各種疾病的基因。